Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX5Q9Y5X3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX5Q9Y5X3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX5Q9Y5X3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX5Q9Y5X3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX5Q9Y5X3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms