Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAXBP1Q9Y5B6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAXBP1Q9Y5B6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms