Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB11Q9Y547 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSPB11Q9Y547 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HSPB11Q9Y547 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPB11Q9Y547 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms