Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHKBQ9Y259 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHKBQ9Y259 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHKBQ9Y259 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHKBQ9Y259 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms