Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP18Q9UMW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP18Q9UMW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP18Q9UMW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP18Q9UMW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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