Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
INO80Q9ULG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
INO80Q9ULG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
INO80Q9ULG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
INO80Q9ULG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
INO80Q9ULG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
INO80Q9ULG1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
INO80Q9ULG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms