Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSL6Q9UKU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL6Q9UKU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL6Q9UKU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL6Q9UKU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms