Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO9Q9UK97 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO9Q9UK97 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO9Q9UK97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FBXO9Q9UK97 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms