Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG3Q9UGV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDRG3Q9UGV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDRG3Q9UGV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDRG3Q9UGV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms