Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKLFQ9UBR5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CKLFQ9UBR5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CKLFQ9UBR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CKLFQ9UBR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms