Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRMT1Q9NXH9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRMT1Q9NXH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT1Q9NXH9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRMT1Q9NXH9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRMT1Q9NXH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRMT1Q9NXH9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms