Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHCHD3Q9NX63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHCHD3Q9NX63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD3Q9NX63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHCHD3Q9NX63 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.4 ms