Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TBCCD1Q9NVR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TBCCD1Q9NVR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TBCCD1Q9NVR7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TBCCD1Q9NVR7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TBCCD1Q9NVR7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms