Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCND1Q9NSA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KCND1Q9NSA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KCND1Q9NSA2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KCND1Q9NSA2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCND1Q9NSA2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCND1Q9NSA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms