Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AKIP1Q9NQ31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AKIP1Q9NQ31 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AKIP1Q9NQ31 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKIP1Q9NQ31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AKIP1Q9NQ31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms