Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARFGAP3Q9NP61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARFGAP3Q9NP61 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGAP3Q9NP61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGAP3Q9NP61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFGAP3Q9NP61 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms