Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEK6Q9HC98 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEK6Q9HC98 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEK6Q9HC98 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK6Q9HC98 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK6Q9HC98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 537.8 ms