Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C5orf42Q9H799 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C5orf42Q9H799 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C5orf42Q9H799 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
C5orf42Q9H799 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C5orf42Q9H799 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
C5orf42Q9H799 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
C5orf42Q9H799 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C5orf42Q9H799 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C5orf42Q9H799 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms