Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SENP3Q9H4L4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SENP3Q9H4L4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SENP3Q9H4L4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SENP3Q9H4L4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
SENP3Q9H4L4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
SENP3Q9H4L4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
SENP3Q9H4L4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms