Protein–RNA interactions for Protein: Q9H467

CUEDC2, CUE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC2Q9H467 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CUEDC2Q9H467 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CUEDC2Q9H467 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CUEDC2Q9H467 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CUEDC2Q9H467 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUEDC2Q9H467 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms