Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
REXO4Q9GZR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REXO4Q9GZR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO4Q9GZR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO4Q9GZR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO4Q9GZR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms