Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCSER1Q9C0I3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCSER1Q9C0I3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CCSER1Q9C0I3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCSER1Q9C0I3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCSER1Q9C0I3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCSER1Q9C0I3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCSER1Q9C0I3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCSER1Q9C0I3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
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