Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM9Q9C026 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM9Q9C026 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIM9Q9C026 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM9Q9C026 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM9Q9C026 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM9Q9C026 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms