Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STRA6Q9BX79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRA6Q9BX79 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRA6Q9BX79 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRA6Q9BX79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STRA6Q9BX79 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms