Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RSRP1Q9BUV0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSRP1Q9BUV0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RSRP1Q9BUV0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RSRP1Q9BUV0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms