Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRADC1Q9BSG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRADC1Q9BSG0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRADC1Q9BSG0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRADC1Q9BSG0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms