Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMAD5Q99717 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SMAD5Q99717 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMAD5Q99717 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMAD5Q99717 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMAD5Q99717 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms