Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGREF1Q99674 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CGREF1Q99674 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CGREF1Q99674 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CGREF1Q99674 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CGREF1Q99674 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms