Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EIF3CQ99613 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EIF3CQ99613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EIF3CQ99613 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EIF3CQ99613 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EIF3CQ99613 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms