Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
SCAF11Q99590 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
SCAF11Q99590 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SCAF11Q99590 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
SCAF11Q99590 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
SCAF11Q99590 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
SCAF11Q99590 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
SCAF11Q99590 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
SCAF11Q99590 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SCAF11Q99590 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SCAF11Q99590 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms