Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LGMNQ99538 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LGMNQ99538 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LGMNQ99538 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LGMNQ99538 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LGMNQ99538 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms