Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGAP3Q96P47 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGAP3Q96P47 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGAP3Q96P47 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGAP3Q96P47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AGAP3Q96P47 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms