Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ANKRD27Q96NW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ANKRD27Q96NW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ANKRD27Q96NW4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ANKRD27Q96NW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms