Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEC16BQ96JE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SEC16BQ96JE7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC16BQ96JE7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEC16BQ96JE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEC16BQ96JE7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms