Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DHX58Q96C10 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DHX58Q96C10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DHX58Q96C10 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DHX58Q96C10 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX58Q96C10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DHX58Q96C10 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX58Q96C10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DHX58Q96C10 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms