Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC47Q96A33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC47Q96A33 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC47Q96A33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC47Q96A33 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC47Q96A33 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.8 ms