Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPDL3AQ92484 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPDL3AQ92484 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPDL3AQ92484 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMPDL3AQ92484 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPDL3AQ92484 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPDL3AQ92484 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms