Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC13A3Q8WWT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC13A3Q8WWT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC13A3Q8WWT9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC13A3Q8WWT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms