Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM3Q8N126 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM3Q8N126 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CADM3Q8N126 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CADM3Q8N126 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CADM3Q8N126 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM3Q8N126 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM3Q8N126 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms