Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PASD1Q8IV76 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PASD1Q8IV76 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PASD1Q8IV76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PASD1Q8IV76 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PASD1Q8IV76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms