Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
PPARGC1BQ86YN6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
PPARGC1BQ86YN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.86■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PPARGC1BQ86YN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PPARGC1BQ86YN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PPARGC1BQ86YN6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC39.67■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PPARGC1BQ86YN6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PPARGC1BQ86YN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms