Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

Predictions only

Length 4,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PKHD1L1Q86WI1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKHD1L1Q86WI1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKHD1L1Q86WI1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms