Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LDB1Q86U70 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDB1Q86U70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDB1Q86U70 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LDB1Q86U70 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDB1Q86U70 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms