Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
HECW1Q76N89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
HECW1Q76N89 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
HECW1Q76N89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
HECW1Q76N89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC40.06■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
HECW1Q76N89 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
HECW1Q76N89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
HECW1Q76N89 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.02■■■■■ 4
HECW1Q76N89 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
HECW1Q76N89 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
HECW1Q76N89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
HECW1Q76N89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
HECW1Q76N89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms