Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP34Q70CQ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP34Q70CQ2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP34Q70CQ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP34Q70CQ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP34Q70CQ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms