Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS13CQ709C8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS13CQ709C8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS13CQ709C8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS13CQ709C8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms