Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00173Q6ZV60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00173Q6ZV60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00173Q6ZV60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms