Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL17Q6TDP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL17Q6TDP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL17Q6TDP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms