Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRFN4Q6PJG9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRFN4Q6PJG9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRFN4Q6PJG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRFN4Q6PJG9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms