Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TIGD3Q6B0B8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIGD3Q6B0B8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIGD3Q6B0B8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIGD3Q6B0B8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms